細胞染色是以細胞形念學為基礎，結合運用化學反應的原理對血細胞內的各種化學物質做定性定位和半定量分析的方法。細胞染色常用的三種方法巴氏染色法、瑞特—吉姆薩染色法、蘇木精—伊紅染色法，下面我們來仔細說說。
（1）巴氏染色法：本法染色特點是細胞具有多色性顏色，色彩鮮艷多彩。涂片染色的透明性好，胞質顆粒分明，胞核結構清晰，如鱗狀上皮過度角化細胞胞質呈橘黃色；角化細胞顯粉紅色；而角化前細胞顯淺綠色或淺藍色，適用于上皮細胞染色或觀察陰道涂片中激素水平對上皮細胞的影響。此方法的缺點是染色程序比較復雜。
（2）瑞特—吉姆薩染色法（wrightgiemsa atain）；本方法多用于血液，骨髓細胞學檢查。胞質內顆粒與核安危質結構顯示較清晰。操作簡便。
（3）蘇木精—伊紅染色法（hemotoxylin eosin，HE）：該方法染色透明度好，核與胞質對比鮮明。染色步驟簡便，效果穩定。適用于痰液涂片，觖質核呈紫藍色，胞質淡玫瑰紅色，紅細胞呈淡朱紅色。
細胞染色的基本原理：酶標抗體與熒光色素標記抗體的染色相同，亦分直接法和間接法。直接法是將酶直接標記在每一抗體上，間接法是將酶標記在第二抗體上，檢測組織細胞內的特定抗原物質。間接法所用的抗體是對組織細胞內某種抗原的特異性抗體（80%～90%的抗血清系由家兔制得，而絕大數單克隆抗體系由小鼠制備）；第二抗體則為抗體（家兔/小鼠的IgG）的抗體。所以，只要不同的抗體均來自同一種屬，同一標記的第二抗體就能用來顯示其不同特異性抗原的存在，這樣可避免了直接法中標記每一種抗體的麻煩，并且提高了方法的敏感度。目前的ICC染色中，以間接法為常用。
